Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOR4AQ9NXH8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms