Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms