Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM106BQ9NUM4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms