Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms