Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SALL1Q9NSC2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SALL1Q9NSC2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms