Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms