Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HELLSQ9NRZ9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms