Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6BQ9NRW1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms