Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX15Q9NRS6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX15Q9NRS6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms