Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TULP4Q9NRJ4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms