Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRDM7Q9NQW5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRDM7Q9NQW5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms