Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms