Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms