Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SHARPINQ9H0F6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms