Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms