Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC2Q9BYS8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC2Q9BYS8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms