Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOL6Q9BWW8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms