Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CENPOQ9BU64 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms