Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COPS4Q9BT78 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms