Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLF1Q9BQI6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms