Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SEMA3CQ99985 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms