Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3Q99687 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms