Protein–RNA interactions for Protein: Q99500

S1PR3, Sphingosine 1-phosphate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR3Q99500 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
S1PR3Q99500 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms