Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GPR78Q96P69 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms