Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
YTHDC1Q96MU7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
YTHDC1Q96MU7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms