Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM47Q96LD4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM47Q96LD4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms