Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
LINC00208Q96KT6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms