Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms