Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG3Q96JB2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG3Q96JB2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms