Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCC12Q96J65 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCC12Q96J65 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms