Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM5Q96DZ9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM5Q96DZ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM5Q96DZ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM5Q96DZ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM5Q96DZ9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM5Q96DZ9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM5Q96DZ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM5Q96DZ9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM5Q96DZ9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM5Q96DZ9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms