Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPTSSAQ969W0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms