Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKL1Q969V6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKL1Q969V6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms