Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFKQ969G6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms