Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SEMA4DQ92854 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SEMA4DQ92854 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SEMA4DQ92854 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SEMA4DQ92854 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA4DQ92854 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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