Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3BQ92485 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms