Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASKIN1Q8WXD9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASKIN1Q8WXD9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASKIN1Q8WXD9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASKIN1Q8WXD9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CASKIN1Q8WXD9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms