Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC107Q8WV48 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms