Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms