Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNDC9Q8TBE3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms