Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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SMIM20Q8N5G0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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SMIM20Q8N5G0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM20Q8N5G0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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