Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUFY3Q7L099 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUFY3Q7L099 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms