Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms