Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGAP27Q6ZUM4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP27Q6ZUM4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms