Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms