Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms