Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms