Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC171Q6TFL3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms