Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BLOC1S2Q6QNY1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms