Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q6P435 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q6P435 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q6P435 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q6P435 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q6P435 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q6P435 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q6P435 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q6P435 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Q6P435 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q6P435 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6P435 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6P435 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms